เขาค้นหาเอกสารเกี่ยวกับทะเลสำหรับงานของโรงเรียน ซึ่งจะทำให้ประตูวิเศษของโดราเอมอนเปิดออก และพาโนบิตะไปยังชิซูกะ เกียน และซูเอโนะในมหาสมุทรลึก คราวนี้เพื่อนๆ ของเราลงเรือลำใหญ่และมีเอกลักษณ์เฉพาะตัวเพื่อเรียนรู้เกี่ยวกับความลึกลับของท้องทะเลและค้นหาสมบัติ สิ่งที่ไม่มีใครจินตนาการได้ก็คือการบิดเบือนในแนวกาล-อวกาศจะนำพวกเขาไปสู่ศตวรรษที่ 17 ท่ามกลางพายุใหญ่ที่จะทำให้พวกเขาพังทลาย และที่ที่โดราเอมอนสูญเสียกระเป๋าเวทมนตร์ไป ไม่มีเวลาให้เสียเพื่อนของเราต้องหาทางออก พวกเขาจะประสบความสำเร็จหรือไม่?